أنشئ قسم الانتاج المعرفي كأحد الأقسام العلمية ضمن الهيكل التنظيمي للمعهد وفي إطار نظامة الأساسي يهدف لرعاية وتشجيع الإنتاج العلمي داخل وخارج الجامعة , ذلك ان معهد الدراسات الاستراتيجية نهض علي إرث مركز البحوث والترجمة والنشر الذي كان يتولي مسؤلية البحث العلمي بالجامعه .
يقوم القسم وفقاً للنظام لاساسي بالإشراف علي مشاريع الانتاج العلمي من حيث التحكيم والتحويل والتابعة , وفي إطار النشر والحقوق الفكرية يقوم القسم بإصدار مجلة جامعة أم درمان الاسلامية العلمية المحكمة ومجلة الدراسات الإستراتيجية برسم معهد البحوث والدراسات الإستراتيجية.